UGENE для Mac OS

Windows

Linux

Mac OS

Версия: 1.27

36
0

Характеристики

Версия: 1.27

Лицензия: Бесплатно

Обновлено:

Размер: 72.2 МБ

Совместимость: Mac OS X

Язык: Русский

Разработчик: Унипро

Сайт: ugene.unipro.ru

Описание

UGENE Свободное кроссплатформенное биоинформационное программное обеспечение. В UGENE интегрированы десятки известных биоинформационных инструментов и алгоритмов, доступных как через графический интерфейс, так и через командную строку. Используя встроенный дизайнер вычислительных схем различные инструменты и алгоритмы могут быть скомпонованы в вычислительную схему. Чтобы обеспечить максимальное быстродействие вычислений, UGENE использует возможности многоядерных ЦПУ и графических процессоров для оптимизации некоторых вычислительных задач. Имеется также возможность ускорить выполнение необходимой задачи используя облачные вычисления на Amazon EC2. Возможности: - Создание, редактирование и аннотирование нуклеотидных и белковых последовательностей. - Поиск в онлайн базах данных: NCBI, PDB, UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL - Множественное выравнивание последовательностей: Clustal, MUSCLE, Kalign, MAFFT, T-Coffee - Онлайн и локальный BLAST поиск - Рестрикционный анализ со встроенной базой данных ферментов рестрикции REBASE - Интегрированный пакет Primer3 для дизайна ПЦР праймеров - Поиск повторов в последовательности ДНК: прямых, обратных, тандемных - Конструирование точечных графиков для ДНК последовательностей - Поиск сайтов связывания транскрипционных факторов с использованием весовых матриц или алгоритма SITECON - Выравнивание коротких последовательностей с помощью Bowtie, BWA или модуля сборки контигов UGENE - Поиск открытых рамок считывания - Клонирование in silico - Отображение 3D структуры белков для форматов PDB и MMDB formats, поддержка стереоэффекта - Предсказание вторичной структуры белка с помощью алгоритмов GOR IV и PSIPRED - Интегрированные пакеты HMMER2 и HMMER3 - Построение (используя интегрированный пакет PHYLIP) и отображение филогенетических деревьев - Локальное выравнивание последовательности с использованием оптимизированной версии алгоритма Смита-Ватермана - Комбинирование различных алгоритмов в вычислительную схему с помощью дизайнера вычислительных схем - Поиск шаблона результатов различных алгоритмов в нуклеотидной последовательности с помощью дизайнера запросов - Визуализация данных секвенирования (BAM-файлов) с помощью обозревателя сборок.

Скриншоты

Версии

Если у вас есть информация о доступных версиях программы, вы можете отправить ее нам.

UGENE - 0 отзывов

Удобство

0

Функциональность

0

Скорость работы

0

UGENE можно найти в каталогах

Похожие приложения

Скачать Flash Optimizer для Mac

Flash Optimizer для Mac

Версия: 2.3 (12716)

Скачать Panda Antivirus for Mac

Panda Antivirus for Mac

Версия: спец (96350)

Скачать Elmedia Player

Elmedia Player

Версия: 7.3 (56138)

Скачать GUI Machine для Mac OS

GUI Machine для Mac OS

Версия: 1.5.8 (25502)

Скачать bonzai3d for Mac OS

bonzai3d for Mac OS

Скачать PageRank

PageRank

Актуальные статьи